與賴氨酰氧化酶樣蛋白2(loxl2)相關的治療和診斷方法
【專利說明】與賴氨酰氧化酶樣蛋白2(L0XL2)相關的治療和診斷方法
[0001]相關申請的奪叉引用
[0002] 本申請要求2012年11月9日提交的美國臨時申請第61/724, 858號和2012年10 月30日提交的美國臨時申請第61/720, 350號，所述申請以全文引用的方式并入本文中。
[0003] 關于序列表的陳沐
[0004] 以文本格式代替紙本拷貝提供與本申請相關的序列表，并且在此以引用的方式 并入本說明書中。含有序列表的文本文件的名稱為GILE-077_03W0_ST25.txt。文本文件 66KB，創(chuàng)建于2013年10月30日，并且以電子方式經(jīng)由EFS-Web提交。
技術領域
[0005] 本發(fā)明在一些方面中涉及使用賴氨酰氧化酶樣蛋白2 (L0XL2)的抑制劑和/或與 賴氨酰氧化酶樣蛋白2結(jié)合的藥劑治療并且改善疾病癥狀以及疾病的診斷性和預后性方 法，所述疾病包括與纖維化相關的疾病，如肝臟疾病。
【背景技術】
[0006] 賴氨酰氧化酶樣蛋白2 (L0XL2)是多種纖維化疾病和病況以及腫瘤中所誘導的細 胞外基質(zhì)的蛋白質(zhì)。其由活化成纖維細胞、疾病相關的平滑肌細胞、內(nèi)皮細胞以及上皮細胞 分泌。存在對治療和診斷纖維化疾病和病況以及與L0LX2相關的其它疾病和病況（包括與 纖維化相關的肝臟疾病和肺臟疾?。┑男枨?。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0007] 本發(fā)明在一些方面中涉及檢測、診斷以及治療疾病和病況的方法；以及用于此類 方法中的組合物、藥劑、裝置、試劑盒以及分析系統(tǒng)。
[0008] 提供了用于治療或改善疾病或病況的一或多種癥狀的方法，所述疾病或病況如肝 臟疾病或病況；纖維化疾病或病況，例如纖維化肝臟疾病。此類方法一般通過向患有肝臟疾 病或病況的個體投與結(jié)合和/或抑制L0XL2的藥劑來進行，從而治療或改善疾病或病況。
[0009] 在一些實施例中，疾病或病況是肝臟疾病或病況，如肝臟疾病或與纖維化相關 的病況。在一些方面中，疾病或病況選自由以下各者組成的群組：C型肝炎病毒（HCV)、 NASH(非酒精性脂肪性肝炎）、PSC(原發(fā)性硬化性膽管炎）、肝硬化、肝臟纖維化、門靜脈血 壓過高。在一些方面中，疾病或病況選自由以下各者組成的群組：PBC(原發(fā)性膽汁性肝硬 化）、自身免疫性肝炎、酒精性肝硬化、a 1抗胰蛋白酶缺乏疾病、遺傳性血色沉著病、威爾 遜氏病（Wilson's disease)、B型肝炎病毒（HBV)以及HIV相關的脂肪性肝炎。在一些方 面中，肝臟疾病或病況是病毒性肝炎，如HCV或HBV。在一些方面中，肝臟疾病是代償性肝臟 疾病。在其它方面中，其是代償失調(diào)性肝臟疾病，如與腹水、食道靜脈曲張、腦病和/或黃疸 相關的肝臟疾病。
[0010] 在一些實施例中，藥劑是與L0XL2特異性結(jié)合的抗體。在一些方面中，所述抗體是 單克隆抗體。在一些方面中，其是抗體片段，例如Fv、scFv、Fab、Fab' F(ab'）2或Fab 2片段。 在一些方面中，其是單克隆抗體。在一些方面中，所述藥劑是L0XL2的抑制劑，如非競爭性 抑制劑。在一些方面中，藥劑與催化域外的L0XL2結(jié)合，如與L0XL2的SRCR3-4域內(nèi)的抗原 決定基結(jié)合。
[0011] 在一些實施例中，所述抗體與具有重鏈可變區(qū)序列SEQ ID N0:8和/或輕鏈可變 區(qū)序列SEQ ID N0:9和/或具有此類序列的一或多個⑶R的抗體競爭性結(jié)合L0XL2。在一些 實施例中，所述抗體包含重鏈可變區(qū)，其具有與SEQ ID N0:6、SEQ ID N0:8、SEQ ID N0:10、 SEQ ID N0:11、SEQ ID 勵：12中所闡述的序列具有至少75%、80%、85%、90%、95%、96%、 97%、98%、99%或 100%或約 75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100% 一致性的氨基酸序列；和/或輕鏈可變區(qū)，其具有與SEQ ID N0:7、SEQ ID N0:9、SEQ ID N0:13 或 SEQ ID N0:14 的序列具有至少 75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、 99 %或100 %-致性的氨基酸序列。在一些實施例中，所述抗體包含重鏈可變區(qū)，其具有與 SEQ ID N0:8 中所闡述的序列具有至少75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99% 或 100%或約 75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100% - 致性的氨基 酸序列；以及輕鏈可變區(qū)，其具有與SEQ ID N0:9的序列具有至少75%、80%、85%、90%、 95%、96%、97%、98%、99%或100%或約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、 99%或100%-致性的氨基酸序列。在一些實施例中，所述抗體包括SEQ ID N0:8中所闡述 的重鏈可變區(qū)序列的重鏈⑶R和/或SEQ ID N0:9中所闡述的輕鏈可變區(qū)序列的輕鏈⑶R。 在一些方面中，此類⑶R包括⑶R3或包括⑶Rl、OTR2和/或⑶R3，如此類重鏈和輕鏈序列 的 CDR1、CDR2 和 / 或 CDR3。
[0012] 在一些實施例中，所述藥劑以處于或約或至少處于或至少約10mg/kg或20mg/kg 或約10mg/kg與20mg/kg之間的劑量投與，以至少處于或至少約或處于或約200mg或700mg 或約200mg與700mg之間的劑量投與，以至少處于或至少約或處于或約75mg或125mg或 75mg與125mg之間或約75mg與125mg之間的劑量投與。在其它實施例中，所述藥劑以 處于或約或至少處于或約 l〇mg/kg、15mg/kg、20mg/kg、25mg/kg、30mg/kg、35mg/kg、40mg/ kg、45mg/kg、50mg/kg、55mg/kg、60mg/kg、65mg/kg、70mg/kg、80mg/kg、90mg/kg、100mg/ kg、125mg/kg、150mg/kg、175mg/kg、200mg/kg、225mg/kg、250mg/kg、275mg/kg、300mg/kg、 325mg/kg、350mg/kg、375mg/kg、400mg/kg、425mg/kg、450mg/kg、475mg/kg 或 500mg/kg 的劑 量投與。在此類實施例的一些方面中，靜脈內(nèi)投與所述藥劑，例如通過輸注。在此類實施例 的一些方面中，皮下投與所述藥劑。在此類實施例的一些方面中，每周或每隔一周投與所述 藥劑。在另一個實施例中，每隔一周、兩周、三周、四周、五周或六周投與所述藥劑。在又一 個實施例中，在一個月、兩個月、三個月、四個月、五個月、六個月、七個月、八個月、九個月或 十個月的時間段內(nèi)多次投與所述藥劑。
[0013] 在一些實施例中，所述方法增加或延長個體的生存期，減少或防止橋接纖維化增 加，減少或防止a平滑肌肌動蛋白（a SMA)含量增加，減少或防止星狀細胞活化增加，和/ 或減少或防止丙氨酸轉(zhuǎn)氨酶（ALT)或天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶（AST)增加。在一些實施例中，所述 方法進一步包括評定橋接纖維化、a平滑肌肌動蛋白（a SMA)含量、星狀細胞活化、丙氨酸 轉(zhuǎn)氨酶（ALT)、天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶（AST)、Y _谷氨酰轉(zhuǎn)移酶（GGT)和/或炎癥和/或壞死的 步驟。在一些方面中，所述方法包括確定相比于無治療的情況或參數(shù)的預處理測量，此類參 數(shù)降低或參數(shù)提高得以阻止。在一些情況下，所述方法將ALT、AST、GGT或ALT/AST比率降 低到低于上限或正常值（ULN)或少于正常值上限（ULN)的2倍、5倍或10倍。在一些情況 下，所述方法減少例如纖維化或患病組織中的炎癥和/或壞死。
[0014] 在一些方面中，所述方法進一步包括檢測或監(jiān)測步驟，如檢測例如蛋白質(zhì)或mRNA 的L0XL2基因產(chǎn)物的水平。在一些方面中，此類檢測和監(jiān)測步驟指示治療功效。
[0015] 還提供了檢測例如L0XL2多肽的賴氨酰氧化酶樣蛋白2 (L0XL2)的方法以及其在 診斷、預后、預測以及治療方法中的用途。舉例來說，提供了檢測和/或定量L0XL2的分析， 如檢測和/或定量個體中的循環(huán)的賴氨酰氧化酶樣蛋白2(L0XL2)多肽的分析。還提供了 診斷性、預后性以及預測性應用中此類分析的方法和用途以及供用于所述分析的試劑盒和 分析裝置。
[0016] 提供了在個體中檢測L0XL2 (典型地為循環(huán)L0XL2)的方法。在所提供的方法中有 檢測方法、診斷方法、預測方法、監(jiān)測方法以及預后方法。在一些實例中，通過使獲自個體的 樣品（一般是液體樣品）與對L0XL2具有特異性的抗體接觸以及檢測所述抗體與樣品中存 在的多肽（例如L0XL2多肽）的結(jié)合來進行所述方法。在一些實例中，所述分析法檢測到 液體樣品中的L0XL2達到300pg/mL、250pg/mL、200pg/mL、175pg/mL或更少，或檢測到樣品 中的11)乂1^2濃度低到30(^8/1111^、25(^8/1111^、20(^8/1111^、175。8/1111^例如低到約15(^8/1111^到約 175pg/mL，約 125pg/mL 到約 150pg/mL，約 100pg/mL 到約 125pg/mL，約 75pg/mL 到約 100pg/ mL，約 50pg/mL 到約 75pg/mL，或約 40pg/mL 到約 50pg/mL。
[0017] 在一些實例中，所檢測到的L0XL2水平指示疾病或病況存在或不存在。在一些實 例中，其指示個體將對疾病的特定治療作出反應的可能性，或指示治療功效。在一些實例 中，如其中方法是預后方法，所檢測到的L0XL2水平指示疾病或病況的結(jié)果、事件或終點的 可能性。在一些方面中，疾病或病況通過循環(huán)L0XL2表征或與循環(huán)L0XL2或較高循環(huán)L0XL2 相關。在一些方面中，個體患有疾病或病況；在一些方面中，個體疑似患有疾病或病況。在 一些方面中，所述方法進一步包括判定個體患有或未患有疾病或病況，可能或不可能對特 定治療作出反應，或可能或不可能具有特定結(jié)果或事件，或治療有效或無效。
[0018] 在一些實例中，所述個體經(jīng)受疾病或病況治療，并且低于如治療前水平的較早時 間點測定的水平的L0XL2檢測水平指示治療功效。
[0019] 所述樣品典型地是液體樣品，如血液、血液部分（如血清