1.一種量化評(píng)估病原體進(jìn)化方向多樣性的方法,其特征在于,針對(duì)給定的病原體,收集病原體的基因型數(shù)據(jù),使用相關(guān)方法對(duì)序列進(jìn)行特征提取,再根據(jù)所提取的特征向量和自然聚類結(jié)果生成特征矩陣,利用聚類評(píng)價(jià)方法進(jìn)行病原體進(jìn)化方向多樣性的量化計(jì)算。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的量化評(píng)估病原體進(jìn)化方向多樣性的方法,其特征在于,包括如下步驟:
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的量化評(píng)估病原體進(jìn)化方向多樣性的方法,其特征在于,所述步驟1)中的核心基因序列為具有病原體核心特征的特定基因序列或者全長(zhǎng)基因組序列,序列類型包括核酸序列或氨基酸序列。
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的量化評(píng)估病原體進(jìn)化方向多樣性的方法,其特征在于,所述特征向量的提取方法,包括如下步驟:
5.根據(jù)權(quán)利要求2所述的量化評(píng)估病原體進(jìn)化方向多樣性的方法,其特征在于,所述步驟3)中病原體的進(jìn)化方向多樣性評(píng)價(jià)指標(biāo)的計(jì)算方法包括如下步驟:
6.權(quán)利要求1-5任一所述的量化評(píng)估病原體進(jìn)化方向多樣性的方法在制備評(píng)價(jià)病原體傳播外溢風(fēng)險(xiǎn)產(chǎn)品中的應(yīng)用。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的應(yīng)用,其特征在于,所述評(píng)價(jià)病原體傳播外溢風(fēng)險(xiǎn)的標(biāo)準(zhǔn)為病原體的進(jìn)化方向多樣性評(píng)價(jià)指標(biāo)值越大說(shuō)明類別分布越混亂,進(jìn)化方向多樣性越高,病原體傳播外溢風(fēng)險(xiǎn)越高;病原體的進(jìn)化方向多樣性評(píng)價(jià)指標(biāo)值越小說(shuō)明類別之間差異越大,進(jìn)化方向集中,病原體傳播外溢風(fēng)險(xiǎn)越低。
8.一種評(píng)價(jià)病原體傳播外溢風(fēng)險(xiǎn)產(chǎn)品,包括計(jì)算機(jī)程序,其特征在于,該計(jì)算機(jī)程序被處理器執(zhí)行時(shí)實(shí)現(xiàn)權(quán)利要求1至5任一中所述的步驟,得到病原體的進(jìn)化方向多樣性評(píng)價(jià)指標(biāo);并根據(jù)病原體的進(jìn)化方向多樣性評(píng)價(jià)指標(biāo)的大小評(píng)價(jià)病原體傳播外溢風(fēng)險(xiǎn)。
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的產(chǎn)品,其特征在于,所述評(píng)價(jià)病原體傳播外溢風(fēng)險(xiǎn)的標(biāo)準(zhǔn)為病原體的進(jìn)化方向多樣性評(píng)價(jià)指標(biāo)值越大說(shuō)明類別分布越混亂,進(jìn)化方向多樣性越高,病原體傳播外溢風(fēng)險(xiǎn)越高;病原體的進(jìn)化方向多樣性評(píng)價(jià)指標(biāo)值越小說(shuō)明類別之間差異越大,進(jìn)化方向集中,病原體傳播外溢風(fēng)險(xiǎn)越低。