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一種β?內(nèi)酰胺類抗生素敏感性的快速檢測方法與流程

文檔序號:11131562閱讀:2015來源:國知局
一種β?內(nèi)酰胺類抗生素敏感性的快速檢測方法與制造工藝

本發(fā)明涉及一種抗生素敏感性快速檢測方法,具體涉及采用等溫微量熱法檢測β-內(nèi)酰胺酶抗生素敏感性的快速檢測方法,屬于生化分析領域。



背景技術:

β-內(nèi)酰胺類抗生素是一類含有β-內(nèi)酰胺環(huán)的抗菌藥物,包括青霉素類,頭孢菌素類,碳青霉烯類以及單環(huán)β-內(nèi)酰胺類等。β-內(nèi)酰胺抗生素主要通過抑制與細菌細胞壁肽聚糖合成相關的 PBPs 轉(zhuǎn)肽酶來實現(xiàn)殺菌目的。自1928年青霉素的發(fā)現(xiàn)以來,β-內(nèi)酰胺類抗生素被長期用于細菌感染的治療,顯著提高了人類的生命健康質(zhì)量。然而,隨著抗生素的不合理使用,細菌的耐藥性問題日益凸顯。在全球范圍內(nèi),抗生素耐藥已成為導致患者發(fā)病及死亡的重要原因。因此,及時監(jiān)測細菌耐藥對于感染病人治療方案的確定和預防醫(yī)院內(nèi)病菌的交叉感染具有重要意義。

傳統(tǒng)的抗生素敏感性檢測方法為瓊脂稀釋法,即最小抑菌濃度MIC檢測法。該方法通過將抗菌藥物配制到瓊脂培養(yǎng)基中,制成一系列藥物濃度遞減的培養(yǎng)基以用于細菌過夜培養(yǎng),以未見細菌生長的最低抗生素濃度(即MIC值)來評估細菌的藥敏性。該方法的優(yōu)點是定量、準確,其主要缺點是操作復雜耗時長,通常得到測試結果需要16到24小時,對于一些生長較慢的菌種所需時間更長。細菌對β-內(nèi)酰胺類抗生素耐藥的主要機制是細菌進化產(chǎn)生一種抗生素鈍化酶,即β-內(nèi)酰胺酶,其催化的β-內(nèi)酰胺環(huán)水解反應可以導致該類抗生素失效。因此,近年來,基于抗生素鈍化酶基因或生化活性的耐藥檢測方法越來越受歡迎。該方法的優(yōu)點是可以較快地從分子水平確定特定β-內(nèi)酰酶的表達,缺點是其所用引物只能用于檢測已知基因,不能用于新β-內(nèi)酰胺酶基因和突變基因的檢測。直接檢測細菌β-內(nèi)酰胺酶活性的實驗方法也有報道,例如伯納烏、皮雷利等人采用紫外分光光度法分析細菌裂解液水解β-內(nèi)酰胺抗生素水平以提供其耐藥信息。但是該方法工作量大,而且仍需要數(shù)個小時才能得出測試結果。



技術實現(xiàn)要素:

本發(fā)明的目的是提供一種方便快捷、操作簡單,基于等溫滴定微量熱技術快速檢測β-內(nèi)酰胺酶耐藥特征的方法。該方法通過實時觀察樣品(e.g. β-內(nèi)酰胺酶溶液或臨床細菌)與抗生素混合后是否產(chǎn)生熱量變化(抗生素水解是放熱反應)從而快速獲得藥物對樣品的敏感信息,或樣品是否含β-內(nèi)酰胺酶(e.g. 產(chǎn)酶菌株),對臨床用藥指導和預防耐藥細菌傳播具有重要指導意義。

本發(fā)明實現(xiàn)過程如下:

一種β-內(nèi)酰胺酶藥敏快速檢測方法:將待測樣品與β-內(nèi)酰胺類抗生素在等溫滴定微量熱儀反應池中混合,記錄實時熱量變化,通過是否產(chǎn)生熱量變化判斷樣品對藥物的敏感信息,若放出熱量,則待測樣品含有β-內(nèi)酰胺酶活。

上述待測樣品為純化的蛋白質(zhì)、細菌裂解液或臨床細菌。

上述臨床細菌為大腸桿菌、鮑曼不動桿菌、綠膿桿菌、肺炎克雷伯菌、屎腸球菌或金黃色葡萄球菌。

上述β-內(nèi)酰胺類抗生素為青霉素類、頭孢菌素類、碳青霉烯類、單環(huán)β-內(nèi)酰胺類。

具體地說,上述的β-內(nèi)酰胺酶藥敏快速檢測方法,包括以下步驟:

1)給等溫滴定微量熱儀樣品池加待測樣品,待測樣品濃度為純化蛋白質(zhì)0.5-50 nM 或細菌懸液 OD600 = 1~20;

2)滴定針加樣β-內(nèi)酰胺類抗生素藥物,抗生素濃度 1-5 mM,緩沖液含50 mM Tris,pH 7.0;

3)將滴定針中β-內(nèi)酰胺類抗生素藥物加入樣品池,實時記錄樣品池中熱量變化;反應條件:滴定體積 20-40μL,spacing time = 400s,滴定針轉(zhuǎn)速750 rpm, 反應溫度25 oC。

本發(fā)明具有如下優(yōu)點:

(1)該方法靈敏快速,可以在10分鐘內(nèi)快速獲得β-內(nèi)酰胺酶是否對特定抗生素具有水解活性或樣品是否含β-內(nèi)酰胺酶的信息。大大節(jié)省了傳統(tǒng)藥敏測試的時間,因此可以用于臨床實驗室進行快速耐藥分析,指導醫(yī)生確定臨床用藥方案。

(2)該方法操作簡單,無需標記抗生素也無需根據(jù)不同抗生素調(diào)整實驗條件,唯一的探針是熱量的變化。因此,所有的β-內(nèi)酰胺抗生素都可以采用相同的實驗體系進行測試,避免了紫外分光光度法中不同抗生素需要選擇不同檢測波長的缺點。

(3)本方法應用性廣,既可用于純化的蛋白,也可用于細菌裂解液、甚至是活細菌的耐藥檢測,而紫外分光光度法不適用于懸濁液的分析。

附圖說明

圖1為實施例1中純化的金屬β-內(nèi)酰胺酶L1與青霉素G、亞胺培南、先鋒霉素(V)進行滴定的ITC圖譜;

圖2為實施例1中表達L1蛋白的重組大腸桿菌細胞(E.coli-L1)與青霉素G、亞胺培南、先鋒霉素(V)進行滴定的ITC圖譜;

圖3為實施例2中臨床大腸桿菌與三種β-內(nèi)酰胺抗生素的ITC圖譜;

圖4為實施例3中臨床鮑曼不動桿菌與三種β-內(nèi)酰胺藥物的ITC圖譜。

具體實施方式

下述實施例中所使用的實驗方法如無特殊說明,均為常規(guī)方法。

下述實施例中所用的材料、試劑等,如無特殊說明,均可從商業(yè)途徑得到。

下述實例中所用等溫滴定微量熱儀型號為馬爾文公司所生產(chǎn)的ITC200量熱儀。

本發(fā)明采用等溫滴定微量熱儀(ITC)進行抗生素耐藥性分析的實驗方法,包括如下步驟:

(1)在等溫滴定微量熱儀(ITC)的滴定針內(nèi)加入1mM 待測抗生素(青霉素、亞胺培南、先鋒霉素等);

(2)在等溫滴定微量熱儀(ITC)的樣品池內(nèi)加入含有待測β-內(nèi)酰胺酶的溶液或待測細菌懸濁液;

(3)設置電腦程序滴加20-40 μL 抗生素至樣品池,滴定針轉(zhuǎn)速750 rpm, 檢測溫度25 oC, 在20 min 內(nèi)通過電腦記錄樣品池中實時熱量變化,直至熱量變化回到基線(所有抗生素被水解完全);

(4)根據(jù)電腦記錄的熱量隨時間變化曲線判定藥物的敏感性,如所述樣品對抗生素具有水解活性,即可觀察到負熱量變化(抗生素水解為放熱反應)。如所述樣品對抗生素無水解活性,或所述樣品不含有β-內(nèi)酰胺酶,則觀察不到負熱量變化。

實施例1、金屬β-內(nèi)酰胺酶L1耐藥分析

如圖1-2所示,本發(fā)明提供的實驗方法可以用于分析金屬β-內(nèi)酰胺酶L1的耐藥性,該實例中圖1使用的樣品是純化的L1蛋白質(zhì),圖2使用的是表達L1蛋白的重組大腸桿菌細胞(E.coli-L1)。根據(jù)該圖,L1 可以水解青霉素G鈉鹽、亞胺培南、先鋒霉素V這三種抗生素,與文獻報道L1抗生素耐藥譜一致。

耐藥分析具體步驟如下:

(1)將L1單克隆大腸桿菌(pET26b-L1)接種于50 mL LB培養(yǎng)液中,37 ℃恒溫隔夜培養(yǎng);

(2)隔天接菌擴大培養(yǎng),待 OD600 達到 0.6,加入 IPTG 誘導反應 3 h 后,離心收集細胞;

(3)步驟(2)所述細胞經(jīng)超聲破碎,收集清液用陰離子交換柱(Q柱)進行純化;

(4)步驟(3)所述純化蛋白透析至ITC緩沖液 (50 mM Tris, pH 7.0),用注射器吸取210 μL上樣至樣品池。優(yōu)選蛋白濃度為20 nM;

(5)如果是細菌實驗,將步驟(2)收集的細菌用ITC緩沖液 (50 mM Tris, pH 7.0)配制成菌懸液,優(yōu)選濃度OD600 = 0.6,用注射器吸取210 μL上樣至樣品池;

(6)配制1 mM 抗生素溶液至 ITC 緩沖液 (50 mM Tris, pH 7.0),上樣至滴定針。設置電腦程序分別滴加20 μL 抗生素溶液至樣品池,實時記錄樣品池內(nèi)熱量變化曲線。滴定針轉(zhuǎn)速優(yōu)選750 rpm,檢測溫度優(yōu)選25 oC;

(7)如圖1,三種抗生素與L1酶混合后均可檢測到負的熱量變化,說明L1可以水解這三種抗生素,且該水解反應是放熱反應。其中L1酶催化青霉素G鈉鹽的水解反應最快,熱量變化最快回到基線水平(180 sec)。如圖2,三種抗生素與步驟(2)中重組大腸桿菌細胞(E.coli-L1)混合后檢測到的熱量變化曲線與圖1類似,說明該方法同樣適用于細菌對β-內(nèi)酰胺的藥敏分析。

實施例2、臨床大腸桿菌β-內(nèi)酰胺耐藥性分析

如圖3所示,本發(fā)明提供的實驗方法可以用于分析臨床大腸桿菌對β-內(nèi)酰胺藥物的耐藥特征,且單次分析在400 sec 內(nèi)即可完成。該實例中使用的樣品是經(jīng)西安交通大學第一附屬醫(yī)院從臨床病人體液中分離得到的一株大腸桿菌菌株。

具體步驟如下:

(1)挑取新鮮血平板上的單菌落用MH肉湯培養(yǎng)液在37℃進行隔夜培養(yǎng);

(2)離心培養(yǎng)液,用 ITC 緩沖液 (50 mM Tris, pH 7.0) 配制成 OD600 = 1~4 的菌懸液,優(yōu)選濃度 OD600 = 3,用注射器吸取210 μL至樣品池;

(3)如實施例1步驟(6)進行菌液ITC藥敏實驗。步驟(2)中的臨床菌懸液分別與1mM 的青霉素G、亞胺培南、先鋒霉素(V)進行滴定。 反應條件:滴定體積 20 μL,spacing time = 400 s,轉(zhuǎn)速750 rpm, 反應溫度25 oC。標準菌株E.coli ATCC 25922 作為陰性參照;

(4)圖3為三種抗生素滴定臨床大腸桿菌和陰性菌株的熱量變化。三種抗生素滴定陰性菌株 E.coli ATCC 25922 均無熱量變化,符合該菌株對抗生素敏感的特征。青霉素G與先鋒霉素(V)滴定臨床大腸桿菌產(chǎn)生負的熱量變化,而滴定亞胺培南無熱量變化,說明該臨床菌株對青霉素G鈉鹽與先鋒霉素(V)有水解活性,對亞胺培南無水解活性;

(5)采用瓊脂稀釋法對該臨床大腸桿菌菌株進行藥敏實驗,結果表明該菌株對

青霉素G、先鋒霉素(V)和亞胺培南的最小抑菌濃度(MIC)分別為 25000、6300 和 1 μg/mL。該測試結果與ITC檢測結果一致,此臨床菌株對青霉素G與先鋒霉素(V)耐藥,對亞胺培南敏感。

實施例3、臨床鮑曼不動桿菌β-內(nèi)酰胺耐藥性分析

如圖4所示,本發(fā)明提供的實驗方法可以用于分析臨床鮑曼不動桿菌對β-內(nèi)酰胺藥物的耐藥特征,且單次分析可在500 sec 內(nèi)完成。該實例中使用的樣品是經(jīng)西安交通大學第一附屬醫(yī)院從臨床病人體液中分離得到的一株鮑曼不動桿菌菌株。

具體步驟如下:

(1)用接種環(huán)在新鮮血平板上直接刮取鮑曼不動桿菌菌落,用ITC緩沖液 (50 mM Tris, pH 7.0) 配制成 OD600 = 1~4 的菌懸液,優(yōu)選濃度 OD600 = 1.4,用注射器吸取210 μL至樣品池;

(2)如實施例1步驟(6)進行菌液ITC藥敏實驗。步驟(1)中的菌液及陰性參照菌液分別與1mM 的青霉素G鈉鹽、亞胺培南、先鋒霉素(V)進行滴定。 反應條件:滴定體積 20μL,spacing time = 400s,轉(zhuǎn)速750 rpm, 反應溫度25 oC;

(4)圖4為三種抗生素滴定臨床大腸桿菌和陰性菌株的熱量變化。三種抗生素滴定陰性菌株均無熱量變化,滴定待測鮑曼不動桿菌均有明顯負的熱量變化,表明該菌株對青霉素G、先鋒霉素(V)和亞胺培南均可水解;

(5)采用瓊脂稀釋法對該臨床鮑曼不動桿菌菌株進行藥敏實驗,結果表明該菌株對青霉素G鈉鹽、先鋒霉素(V)和亞胺培南的最小抑菌濃度(MIC)分別為 25000、6300 和 60 μg/mL。該測試結果與ITC檢測結果一致,此臨床菌株對青霉素G、先鋒霉素(V)以及亞胺培南均耐藥。

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