1.一種水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子標記Pi2-1,其特征在于,所述功能分子標記所擴增的DNA片段包含水稻抗稻瘟病基因Pi2基因組序列的第1543-1545位核苷酸,某些水稻感稻瘟病品種在該位點存在ACA 3個堿基缺失,由引物對SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2從水稻基因組中擴增出抗稻瘟病基因Pi2的DNA片段,經(jīng)電泳檢測DNA片段大小,從而確定水稻抗稻瘟病基因Pi2的完整性,進而確定其稻瘟病抗性。
2.一種水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子標記Pi2-1的引物對,其特征在于,所述引物對的正向引物如SEQ ID NO.1所示,所述引物對的反向引物如SEQ ID NO.2所示。
3.一種鑒定水稻抗稻瘟病基因Pi2的方法,其特征在于,包括以下步驟:
1)通過常規(guī)PCR法擴增及測序,獲得水稻抗稻瘟病基因Pi2的1個抗病等位基因與1個感病等位基因序列;
2)將步驟1)所獲得的序列進行比對,得到水稻抗稻瘟病基因Pi2的第1543-1545位點處存在ACA 3個堿基缺失,該差異位于該基因的外顯子;
3)對不同水稻的總DNA進行PCR擴增反應,所得擴增產(chǎn)物進行電泳檢測驗證,獲得與水稻抗稻瘟病基因Pi2呈特異性帶型的核苷酸片段;
4)對步驟3)所獲得的分子標記在不同的水稻品種中進行帶型顯色和基因型分型,從而確定水稻抗稻瘟病基因Pi2的完整性,進而確定其稻瘟病抗性。
4.根據(jù)權利要求3所述的鑒定水稻抗稻瘟病基因Pi2的方法,其特征在于,所述步驟3)中的PCR反應體系如下:
5.根據(jù)權利要求3所述的鑒定水稻抗稻瘟病基因Pi2的方法,其特征在于,所述電泳檢測中的8%聚丙烯酰胺凝膠的組成如下:
6.根據(jù)權利要求3所述的鑒定水稻抗稻瘟病基因Pi2的方法,其特征在于,所述顯色中的聚丙烯酰胺凝膠顯色液100ml的組成如下:
7.權利要求1所述的水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子標記Pi2-1在篩選和鑒定水稻稻瘟病抗性品種中的應用。