本發(fā)明涉及分子醫(yī)學(xué)，具體為一種基于染色體不穩(wěn)定評(píng)分在彌漫大b細(xì)胞淋巴瘤預(yù)后評(píng)估的檢測(cè)技術(shù)。

背景技術(shù)：

1、彌漫大b細(xì)胞淋巴瘤(diffuse?large?b-cell?lymphoma,簡(jiǎn)稱dlbcl)是成人最常見的非霍奇金淋巴瘤(non-hodgkin?lymphoma，簡(jiǎn)稱nhl)，約占nhl的25％～50％[1]。一半以上的患者確診時(shí)已超過70歲，生存率隨著年齡的增長(zhǎng)而下降[2,3]。

2、dlbcl的預(yù)后受到多種因素的影響，年齡、分期、雙打擊/雙表達(dá)、tp53突變等均與預(yù)后相關(guān)[3-6]。目前，dlbcl的臨床預(yù)后評(píng)估主要依賴于國際預(yù)后指數(shù)(internationalprognostic?index,簡(jiǎn)稱ipi)[7]和基因表達(dá)譜(gene?expression?profiling,簡(jiǎn)稱gep)分類[8]。ipi基于患者的年齡、ldh水平、體能狀態(tài)、疾病分期和淋巴結(jié)外受累部位數(shù)目，而gep則根據(jù)腫瘤細(xì)胞的基因表達(dá)模式將dlbcl分為不同的亞型[7,8]。盡管這些指標(biāo)在一定程度上有助于預(yù)測(cè)患者的預(yù)后，但它們?cè)谀承┣闆r下也存在局限性，例如ipi可能在年輕患者中預(yù)后評(píng)估效果欠佳[9]，而gep需要檢測(cè)樣本rna，但是rna容易降解。因此，研究新的預(yù)后評(píng)估指標(biāo)，以滿足臨床需求和提高預(yù)后預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性變得至關(guān)重要。

3、鑒于現(xiàn)有預(yù)后指標(biāo)的局限性，研究者們一直在尋求能夠提供更精確預(yù)后信息的新指標(biāo)。

4、非專利文獻(xiàn)：

5、中華人民共和國國家衛(wèi)生健康委員會(huì),《彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤診療指南(2022年版)》.http://www.nhc.gov.cn/cms-search/downfiles/697cd66a248e4186bec17040d53a1f3f.pdf.

6、smith?a,crouch?s,howell?d,et?al.impact?of?age?and?socioeconomicstatus?on?treatment?and?survival?from?aggressive?lymphoma:a?uk?population-based?study?of?diffuse?large?b-cell?lymphoma[j].cancer?epidemiology,2015,39(6):1103-1112.

7、g,hagberg?o,jerkeman?m,et?al.the?impact?of?age?on?survival?ofdiffuse?large?b-cell?lymphoma–a?population-based?study[j].acta?oncologica,2015,54(6):916-923.

8、riedell?p?a,smith?s?m.double?hit?and?double?expressors?in?lymphoma:definition?and?treatment[j].cancer,2018,124(24):4622-4632.

9、davies?a,cummin?t?e,barrans?s,et?al.gene-expression?profiling?ofbortezomib?added?to?standard?chemoimmunotherapy?for?diffuse?large?b-celllymphoma(remodl-b):an?open-label,randomised,phase?3trial[j].the?lancetoncology,2019,20(5):649-662.

10、xu-monette?z?y,wu?l,visco?c,et?al.mutational?profile?and?prognosticsignificance?of?tp53?in?diffuse?large?b-cell?lymphoma?patients?treated?withr-chop:report?from?an?international?dlbcl?rituximab-chop?consortium?programstudy[j].blood,the?journal?of?the?american?society?of?hematology,2012,120(19):3986-3996.

11、international?non-hodgkin's?lymphoma?prognostic?factorsproject.apredictive?model?for?aggressive?non-hodgkin's?lymphoma[j].newengland?journal?of?medicine,1993,329(14):987-994.

12、wright?g,tan?b,rosenwald?a,et?al.agene?expression-based?method?todiagnose?clinically?distinct?subgroups?of?diffuse?large?b?cell?lymphoma[j].proceedings?of?the?national?academy?of?sciences,2003,100(17):9991-9996.

13、hamlin?p?a,zelenetz?ad,kewalramani?t,et?al.age-adjusted?internationalprognostic?index?predicts?autologous?stem?cell?transplantation?outcome?forpatients?with?relapsed?or?primary?refractory?diffuse?large?b-cell?lymphoma[j].blood,2003,102(6):1989-1996.

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本發(fā)明可以對(duì)彌漫大b細(xì)胞淋巴瘤預(yù)后評(píng)估的關(guān)鍵標(biāo)志物進(jìn)行篩選，獲得基因變異結(jié)果和染色體不穩(wěn)定性評(píng)分，通過評(píng)分結(jié)果的不同，提示患者術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)的高低。

2、為實(shí)現(xiàn)上述目的，本發(fā)明提供如下技術(shù)方案：

3、用于檢測(cè)染色體不穩(wěn)定性的試劑在用于制備彌漫大b細(xì)胞淋巴瘤預(yù)后評(píng)估試劑中的應(yīng)用。

4、所述的用于檢測(cè)染色體不穩(wěn)定性的試劑是通過檢測(cè)基因拷貝數(shù)而獲得染色體不穩(wěn)定性信息的試劑。

5、一種彌漫大b細(xì)胞淋巴瘤預(yù)后評(píng)估的檢測(cè)裝置，包括：

6、組織樣本制備文庫模塊，從患者腫瘤組織樣本中提取dna，經(jīng)超聲破碎后，進(jìn)行文庫制備；

7、測(cè)序模塊，用于對(duì)文庫進(jìn)行高通量測(cè)序，并獲得基因組上不同片段的拷貝數(shù)；

8、數(shù)據(jù)分析模塊，將測(cè)序模塊中獲得的拷貝數(shù)異常的片段的總長(zhǎng)除以全部的檢測(cè)片段的全長(zhǎng)，得到cis值；

9、判定模塊，若cis值大于設(shè)定閾值，則判定為染色體不穩(wěn)定性，樣本具有較差的預(yù)后。

10、所述的拷貝數(shù)異常的片段是通過計(jì)算各個(gè)片段的下機(jī)讀段數(shù)量的log2?ratio值，log2ratio≥0.2或者log2?ratio≤-0.2，則判定為拷貝數(shù)異常。

11、所述的閾值范圍是0.35-0.40。

12、一種計(jì)算機(jī)可讀取介質(zhì)，其記載有能夠運(yùn)行彌漫大b細(xì)胞淋巴瘤預(yù)后評(píng)估方法的計(jì)算機(jī)程序代碼：

13、步驟1，獲得對(duì)文庫進(jìn)行高通量測(cè)序而得到的基因組上不同片段的拷貝數(shù)；所述的文庫是從患者腫瘤組織樣本中提取dna，經(jīng)超聲破碎后，進(jìn)行文庫制備而得到；

14、步驟2，將獲得的拷貝數(shù)異常的片段的總長(zhǎng)除以全部的檢測(cè)片段的全長(zhǎng)，得到cis值；

15、步驟3，若cis值大于設(shè)定閾值，則判定為染色體不穩(wěn)定性，樣本具有較差的預(yù)后。

16、與現(xiàn)有技術(shù)相比，本發(fā)明的有益效果為：

17、本發(fā)明中染色體不穩(wěn)定性評(píng)分在多因素cox分析中被證實(shí)是dlbcl獨(dú)立預(yù)測(cè)預(yù)后的生物標(biāo)志物，表明染色體不穩(wěn)定性評(píng)分能夠提供除了傳統(tǒng)臨床預(yù)后因素(如ipi評(píng)分、年齡、分期等)之外的額外預(yù)后信息，且染色體不穩(wěn)定性評(píng)分提供了一種量化的方法來評(píng)估染色體不穩(wěn)定性，通過量化染色體不穩(wěn)定性，染色體不穩(wěn)定性評(píng)分能夠更精確地預(yù)測(cè)患者的預(yù)后，應(yīng)用該評(píng)分可以用來指導(dǎo)彌漫大b細(xì)胞淋巴瘤患者術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)測(cè)，從而對(duì)其后續(xù)治療進(jìn)行提示作用，并能減少預(yù)后評(píng)估中的主觀性，提高評(píng)估的一致性和可重復(fù)性。