本發(fā)明屬于生物檢測,具體涉及用于測定楊樹黑星病菌交配型的引物組、多重pcr方法及應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、楊樹黑星病是楊樹上一種重要的真菌病害。該病害主要侵染葉片,也可危害新梢。在葉片正面首先出現(xiàn)一個褪綠斑點(diǎn),后逐漸形成深褐色的圓形壞死斑,葉片背面病斑上布滿黑色的霉層,常多個病斑相連,形成不規(guī)則的大斑。雨水沖刷后,斑痕會呈現(xiàn)出灰白色的外觀。發(fā)病嚴(yán)重時,造成葉片焦枯,提早脫落,是楊苗和幼林的危險性病害。研究發(fā)現(xiàn)我國的楊樹黑星病是由 venturia?phaeosepta引起,該病原菌是異宗配合的子囊菌,單個菌株中通常僅存在mat1-1-1基因或mat1-2-1基因,帶有mat1-1-1基因的菌株為mat1-1交配型,帶有mat1-2-1基因的菌株為mat1-2交配型,只有2個不同交配型的菌株相遇才能夠進(jìn)行有性生殖。
2、有性生殖是植物病原真菌遺傳變異的重要來源,也是導(dǎo)致植物病原真菌毒性變異的重要因素,可以大大增強(qiáng)其適應(yīng)性和生存力。異宗配合的真菌需要群體中同時存在兩種不同的交配型菌株才能進(jìn)行有性生殖,因此明確群體中兩種交配型的分布情況,對于判斷群體中是否存在有性生殖至關(guān)重要。傳統(tǒng)的交配型測定方法為對峙培養(yǎng)法,該方法測定時間長達(dá)1-2個月,有時還需要特殊的光照條件和低溫刺激,不適合大規(guī)模樣本的測定。而目前發(fā)展的pcr分子檢測方法,具有快速、準(zhǔn)確的特點(diǎn),特別適合大規(guī)模樣本的測定。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、為了解決現(xiàn)有技術(shù)中的不足,本發(fā)明的目的在于提供用于測定楊樹黑星病菌交配型的引物組、多重pcr方法及應(yīng)用,本發(fā)明以mat基因?yàn)榘袠?biāo),設(shè)計(jì)特異性引物,首次建立 venturia?phaeosepta交配型的多重pcr檢測方法,可大量、快速、準(zhǔn)確鑒定楊樹黑星病菌的交配型。
2、為了實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用的具體方案為:
3、第一方面,本發(fā)明提供用于測定楊樹黑星病菌交配型的多重pcr引物組,包括通用上游引物hxmat-f、mat1-1特異性下游引物hxmat-1r和mat1-2特異性下游引物hxmat-2r;
4、所述hxmat-f的核苷酸序列如seq?id?no:3所示;
5、所述hxmat-1r的核苷酸序列如seq?id?no:4所示;
6、所述hxmat-2r的核苷酸序列如seq?id?no:5所示.
7、第二方面,本發(fā)明提供用于測定楊樹黑星病菌交配型的試劑盒,包含上述的多重pcr引物組。
8、第三方面,本發(fā)明提供上述的多重pcr引物組或試劑盒在測定楊樹黑星病菌交配型中的應(yīng)用。
9、第四方面,一種用于測定楊樹黑星病菌交配型的多重pcr方法,包括以下步驟:
10、步驟一、提取待測病菌的dna;
11、步驟二、以步驟一所得dna為模板,使用權(quán)利要求1所述的引物組進(jìn)行多重pcr擴(kuò)增;
12、步驟三、根據(jù)步驟二擴(kuò)增所得條帶的大小進(jìn)行交配型的判定。
13、作為對上述多重pcr方法的進(jìn)一步優(yōu)化,步驟三所述判定的依據(jù)為:若條帶大小為280bp,則測定為mat1-2交配型;若條帶大小為630bp,則測定為mat1-1交配型。
14、有益效果:本發(fā)明通過全基因組測序獲得mat基因序列,以mat基因?yàn)榘袠?biāo),設(shè)計(jì)特異性引物,建立 venturia?phaeosepta交配型的多重pcr檢測方法。該方法為楊樹黑星病菌交配型的首個分子檢測方法,分子方法的建立將為大量、快速和準(zhǔn)確鑒定楊樹黑星病菌的交配型提供有力支持。
1.用于測定楊樹黑星病菌交配型的多重pcr引物組,其特征在于:包括通用上游引物hxmat-f、mat1-1特異性下游引物hxmat-1r和mat1-2特異性下游引物hxmat-2r;
2.用于測定楊樹黑星病菌交配型的試劑盒,其特征在于:包含權(quán)利要求1所述的多重pcr引物組。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的多重pcr引物組或權(quán)利要求2所述的試劑盒在測定楊樹黑星病菌交配型中的應(yīng)用。
4.一種用于測定楊樹黑星病菌交配型的多重pcr方法,其特征在于:包括以下步驟:
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法,其特征在于:步驟三所述判定的依據(jù)為:若條帶大小為280bp,則測定為mat1-2交配型;若條帶大小為630bp,則測定為mat1-1交配型。