本發(fā)明涉及基因工程,更具體的說是涉及一種參與三萜皂苷生物合成的糖基轉(zhuǎn)移酶編碼基因篩選鑒定及應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、三萜皂苷是中藥斷血流(主要含柴胡皂苷及醉魚草皂苷)和柴胡(以柴胡皂苷為核心活性成分)的關(guān)鍵藥效物質(zhì)。三萜皂苷在天然藥材中的含量較低,面臨化學(xué)提取成本高、純化過程污染嚴(yán)重等問題,在一定程度上限制了其新藥研發(fā)和臨床應(yīng)用。因此,三萜皂苷的生物合成成為研究熱點(diǎn)。
2、三萜皂苷是一類天然化合物,其基本結(jié)構(gòu)包括:三萜骨架和糖鏈,其中糖鏈部分是通過糖苷鍵連接到三萜骨架上,糖鏈的種類、數(shù)量和連接位置決定了三萜皂苷的多樣性和功能。三萜皂苷的糖基化修飾(尤其是c-3位)直接決定其結(jié)構(gòu)多樣性與藥理活性,例如抗炎、免疫調(diào)節(jié)及抗腫瘤等作用。目前研究表明,尿苷二磷酸依賴的糖基轉(zhuǎn)移酶(ugts)是催化三萜皂苷糖基化修飾的核心酶類,負(fù)責(zé)將活化的糖供體,如udp-巖藻糖、udp-葡萄糖、udp-鼠李糖等轉(zhuǎn)移到三萜骨架上,形成糖苷鍵。不同的糖基轉(zhuǎn)移酶可以識別不同的糖供體和受體,從而產(chǎn)生結(jié)構(gòu)多樣的三萜皂苷。因此,糖基轉(zhuǎn)移酶對三萜皂苷的合成至關(guān)重要。
3、然而,目前針對三萜皂苷c-3位糖基化修飾的關(guān)鍵ugt酶及其編碼基因仍未被明確鑒定,導(dǎo)致其生物合成途徑解析受阻,且無法通過合成生物學(xué)手段實(shí)現(xiàn)規(guī)模化生產(chǎn),亟需開展系統(tǒng)性研究。
4、因此,如何提供一種可以催化三萜類化合物c-3位糖基化修飾的糖基轉(zhuǎn)移酶,是本領(lǐng)域技術(shù)人員亟需解決的問題。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、有鑒于此,本發(fā)明提供了一種參與三萜皂苷生物合成的糖基轉(zhuǎn)移酶編碼基因篩選鑒定及應(yīng)用,成功的發(fā)現(xiàn)了可以催化c-3位葡萄糖基化修飾的糖基轉(zhuǎn)移酶,為三萜皂苷類成分合成生物學(xué)研究提供基因元器件,解決了稀有皂苷的生物資源問題。
2、為了實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案:
3、一種參與三萜皂苷生物合成的糖基轉(zhuǎn)移酶,所述糖基轉(zhuǎn)移酶是由seq?id?no.6所示氨基酸序列或seq?id?no.6所示氨基酸序列經(jīng)過替換、缺失和/或添加一個(gè)或多個(gè)氨基酸后仍具有相同酶催化性能的氨基酸序列組成。
4、本發(fā)明的再一目的在于提供:一種編碼上述糖基轉(zhuǎn)移酶的基因,所述基因是由seqid?no.3所示核苷酸序列或seq?id?no.3所示核苷酸序列經(jīng)過替換、缺失和/或添加一個(gè)或多個(gè)堿基后仍具有相同酶催化性能的核苷酸序列組成。
5、本發(fā)明的再一目的在于提供:一種擴(kuò)增上述糖基轉(zhuǎn)移酶基因的引物組,所述引物組包括ccugt-g57755-f和ccugt-g57755-r,具體序列如下:
6、ccugt-g57755-f:5’-atggagatggagatggagaattacgaact-3’,seq?id?no.1;
7、ccugt-g57755-r:5’-ttaagcattattaatgttactaataacatcc?tc-3’,seq?id?no.2。
8、本發(fā)明的再一目的在于提供:一種含有上述糖基轉(zhuǎn)移酶基因的生物材料,所述生物材料為重組載體、表達(dá)盒、轉(zhuǎn)基因細(xì)胞系或重組菌。
9、本發(fā)明的再一目的在于提供上述糖基轉(zhuǎn)移酶或上述編碼糖基轉(zhuǎn)移酶的基因或上述生物材料的應(yīng)用,所述應(yīng)用為以下任一方向:
10、(1)在制備糖基轉(zhuǎn)移酶和/或含有糖基轉(zhuǎn)移酶相關(guān)產(chǎn)品中的應(yīng)用;
11、(2)在制備糖基轉(zhuǎn)移酶突變體和/或含有糖基轉(zhuǎn)移酶突變體相關(guān)產(chǎn)品中的應(yīng)用;
12、(3)在制備重組糖基轉(zhuǎn)移酶和/或含有重組糖基轉(zhuǎn)移酶相關(guān)產(chǎn)品中的應(yīng)用;
13、(4)在三萜皂苷c-3位葡萄糖基化修飾中的應(yīng)用;
14、(5)在三萜皂苷糖基化修飾中的應(yīng)用;
15、(6)在三萜皂苷生物合成中的應(yīng)用。
16、優(yōu)選的,在步驟(4)-(6)的應(yīng)用中糖基轉(zhuǎn)移酶利用糖基供體udp-葡萄糖催化prosaikogenina生成saikosaponinb1、saikosaponin?c1及saikosaponin?x。
17、經(jīng)由上述的技術(shù)方案可知,與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有如下有益效果:
18、本發(fā)明利用液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)檢測風(fēng)輪菜根、莖、葉中8種目標(biāo)成分的含量差異。然后基于風(fēng)輪菜基因組,鑒定風(fēng)輪菜糖基轉(zhuǎn)移酶gt基因家族成員,構(gòu)建進(jìn)化樹分析風(fēng)輪菜與其他物種gt之間的進(jìn)化關(guān)系,初篩參與三萜皂苷糖基化修飾的關(guān)鍵酶。最后基于風(fēng)輪菜不同組織部位轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),分析差異基因表達(dá),進(jìn)一步篩選參與三萜皂苷糖基化修飾的關(guān)鍵酶基因。采用上述方法成功篩選到糖基轉(zhuǎn)移酶基因。
19、利用上述基因構(gòu)建得到pet28a-mbp-ccugt-g57755原核表達(dá)載體,成功獲取了糖基轉(zhuǎn)移酶,以prosaikogenin?a為底物,進(jìn)行了體外酶的催化功能驗(yàn)證。研究發(fā)現(xiàn),本發(fā)明糖基轉(zhuǎn)移酶能利用糖基供體udp-葡萄糖催化prosaikogenina生成saikosaponinb1、saikosaponin?c1及saikosaponin?x。綜上,本發(fā)明糖基轉(zhuǎn)移酶催化三萜類化合物c-3位葡萄糖基化修飾,為三萜皂苷類成分合成生物學(xué)研究提供基因元器件,解決了稀有皂苷的生物資源問題。
1.一種參與三萜皂苷生物合成的糖基轉(zhuǎn)移酶,其特征在于,所述糖基轉(zhuǎn)移酶是由seqid?no.6所示氨基酸序列或seq?id?no.6所示氨基酸序列經(jīng)過替換、缺失和/或添加一個(gè)或多個(gè)氨基酸后仍具有相同酶催化性能的氨基酸序列組成。
2.一種編碼權(quán)利要求1所述糖基轉(zhuǎn)移酶的基因,其特征在于,所述基因是由seq?idno.3所示核苷酸序列或seq?id?no.3所示核苷酸序列經(jīng)過替換、缺失和/或添加一個(gè)或多個(gè)堿基后仍具有相同酶催化性能的核苷酸序列組成。
3.一種擴(kuò)增權(quán)利要求2所述糖基轉(zhuǎn)移酶基因的引物組,其特征在于,所述引物組包括ccugt-g57755-f和ccugt-g57755-r,具體序列如下:
4.一種含有權(quán)利要求2所述糖基轉(zhuǎn)移酶基因的生物材料,其特征在于,所述生物材料為重組載體、表達(dá)盒、轉(zhuǎn)基因細(xì)胞系或重組菌。
5.權(quán)利要求1所述糖基轉(zhuǎn)移酶或權(quán)利要求2所述編碼糖基轉(zhuǎn)移酶的基因或權(quán)利要求4所述生物材料的應(yīng)用,其特征在于,所述應(yīng)用為以下任一方向:
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的應(yīng)用,其特征在于,在步驟(4)-(6)的應(yīng)用中糖基轉(zhuǎn)移酶利用糖基供體udp-葡萄糖催化prosaikogenina生成saikosaponin?b1、saikosaponin?c1和saikosaponin?x。