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特發(fā)性肺纖維化相關(guān)分子靶點(diǎn)的篩選方法及應(yīng)用

文檔序號(hào):41948967發(fā)布日期:2025-05-16 14:06閱讀:來(lái)源:國(guó)知局

技術(shù)特征:

1.特發(fā)性肺纖維化相關(guān)分子靶點(diǎn)的篩選方法,其特征在于,該篩選方法包括以下步驟:

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的特發(fā)性肺纖維化相關(guān)分子靶點(diǎn)的篩選方法,其特征在于,步驟2在微波照射治療過(guò)程中,低功率微波照射組:90v/m,20min/d;高功率微波照射組:250v/m,微波照射20min/d。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的特發(fā)性肺纖維化相關(guān)分子靶點(diǎn)的篩選方法,其特征在于,步驟7中將四組的差異表達(dá)基因結(jié)合識(shí)別公共差異表達(dá)基因,通過(guò)公共差異表達(dá)基因與趨勢(shì)變化基因重疊確定1481個(gè)候選基因,對(duì)候選基因進(jìn)行g(shù)o和kegg富集分析,在752個(gè)go項(xiàng)和31個(gè)kegg通路中顯著富集;并通過(guò)將公共差異表達(dá)基因與趨勢(shì)變化代謝物重疊確定8個(gè)候選基因,對(duì)候選代謝物進(jìn)行kegg富集分析,在5個(gè)kegg途徑中富集。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的特發(fā)性肺纖維化相關(guān)分子靶點(diǎn)的篩選方法,其特征在于,步驟9中對(duì)候選基因與候選代謝物通過(guò)相關(guān)性分析,共鑒定出18個(gè)樞紐基因和5個(gè)關(guān)鍵代謝產(chǎn)物,樞紐基因包括ccl7、cd163、lilrb2、socs3、vstm1、血清蛋白1、ndufs5、izumo1r、np4、per3、nr1d1、nr1d2、tef、loc100912450、fam169b、lrrc39、ms4a4a和satb1;關(guān)鍵代謝產(chǎn)物為西替利嗪正氧化物、抗壞血酸、天冬氨酸-l-脯氨酸、ni3400000和戊二酸。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的特發(fā)性肺纖維化相關(guān)分子靶點(diǎn)的篩選方法,其特征在于,將18個(gè)樞紐基因提交到檢索相互作用基因/蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)中,置信度閾值設(shè)置為0.15,獲得11個(gè)具有蛋白質(zhì)相互作用的基因;利用mirdb和mirwalk預(yù)測(cè)靶向18個(gè)樞紐基因的mirna,通過(guò)重疊兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中預(yù)測(cè)的mirnas確定24個(gè)關(guān)鍵mirnas;通過(guò)將11個(gè)蛋白相互作用基因與24個(gè)關(guān)鍵mirnas相交,建立了一個(gè)由35個(gè)節(jié)點(diǎn)和42條邊組成的蛋白相互作用基因-關(guān)鍵mirna網(wǎng)絡(luò)。

6.根據(jù)權(quán)利要求4所述的特發(fā)性肺纖維化相關(guān)分子靶點(diǎn)的篩選方法,其特征在于,步驟10中,步驟10中分別對(duì)gse166036和gse72073數(shù)據(jù)集進(jìn)行差異表達(dá)分析,將得出的兩組差異表達(dá)基因和樞紐基因的重合部分確定特發(fā)性肺纖維化中的關(guān)鍵基因,關(guān)鍵基因?yàn)閏d163和per3。

7.選擇下列基因的一種或者組合作為特發(fā)性肺纖維化診斷標(biāo)志物的用途,其中,所述基因包括:cd163和per3。

8.選擇下列基因的一種或者組合作為特發(fā)性肺纖維化預(yù)防和/或治療靶點(diǎn)的用途,其中,所述基因包括:cd163和per3。

9.根據(jù)權(quán)利要求8的用途,其特征在于,通過(guò)抑制cd163和/或per3基因的表達(dá)水平,發(fā)揮治療特發(fā)性肺纖維化的作用。


技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開(kāi)了特發(fā)性肺纖維化相關(guān)分子靶點(diǎn)的篩選方法及應(yīng)用,屬于生物醫(yī)藥技術(shù)領(lǐng)域,該篩選方法包括:首先使用TPM評(píng)估了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)中mRNA在不同樣本中的分布偏差。通過(guò)PCA對(duì)代謝數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。隨后,進(jìn)行Mfuzz分析,研究基因和代謝物的表達(dá)趨勢(shì),根據(jù)不同的表達(dá)趨勢(shì)進(jìn)行聚類,識(shí)別趨勢(shì)特異性的基因和代謝物。此外,我們還對(duì)4個(gè)對(duì)照組進(jìn)行了差異表達(dá)分析,隨后進(jìn)行了富集分析。隨后,將差異表達(dá)的基因與趨勢(shì)特異性基因相交,以確定潛在的候選基因和代謝物。通過(guò)對(duì)這些候選代謝物的相關(guān)性分析,鑒定出18個(gè)樞紐基因和5個(gè)關(guān)鍵代謝物的相關(guān)系數(shù)均大于0.85。利用GEO?IPF數(shù)據(jù)庫(kù)將差異表達(dá)基因與鑒定出的關(guān)鍵基因進(jìn)行交叉,發(fā)現(xiàn)了另外兩個(gè)關(guān)鍵基因(Cd163和Per3)。

技術(shù)研發(fā)人員:余維巍,王琪,楊春曉,張存泰
受保護(hù)的技術(shù)使用者:華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院附屬同濟(jì)醫(yī)院
技術(shù)研發(fā)日:
技術(shù)公布日:2025/5/15
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