本發(fā)明涉及生物中，用于檢測(cè)小麥籽粒淀粉含量的分子標(biāo)記與方法。

背景技術(shù)：

1、我國(guó)是世界第一大小麥生產(chǎn)和消費(fèi)國(guó)。淀粉占小麥籽粒干重的70％左右，籽?？偟矸酆渴怯绊懶←湲a(chǎn)量和品質(zhì)的重要因素(shevkani?et?al.,2017)。因此，優(yōu)化小麥籽粒淀粉含量和組份是提升小麥產(chǎn)量和品質(zhì)的一種重要手段。挖掘和利用控制小麥籽?？偟矸酆康南嚓P(guān)基因，不但為分子標(biāo)記輔助育種和轉(zhuǎn)基因育種提供了新的基因資源，也將大幅提高我國(guó)小麥育種水平、加速育種進(jìn)程，對(duì)于小麥高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)育種具有重要意義。

2、淀粉是光合作用的最終產(chǎn)物，也是小麥籽粒中主要的積累物質(zhì)，灌漿期胚乳淀粉的合成和積累與小麥產(chǎn)量和面食品質(zhì)密切相關(guān)。胚乳淀粉合成是一個(gè)受多基因控制的復(fù)雜的生物過(guò)程，包括“源物質(zhì)”轉(zhuǎn)運(yùn)、分解、淀粉鏈合成起始、延伸和分支等多個(gè)階段(huang?etal.,2021)。目前，研究人員發(fā)現(xiàn)參與上述過(guò)程中的多個(gè)關(guān)鍵基因，例如糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因(sut1,bt1和sweet4c等)(scofield?et?al.,2002；sosso?et?al.,2015；cakiret?al.,2016；wang?et?al.,2019)，焦磷酸化酶編碼基因(agpl1/2和agps1/2)(smidanskyet?al.,2002；kang?et?al.,2013；wei?et?al.,2017)，蔗糖合酶基因(sus1和sus2)(li?et?al.,2013；hou?et?al.,2014)均能夠控制胚乳淀粉合成，影響籽粒灌漿和食用品質(zhì)。此外，轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)調(diào)控胚乳淀粉合成相關(guān)基因的表達(dá)，間接控制籽粒產(chǎn)量和品質(zhì)，也為小麥高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)育種提供了一個(gè)新的途徑。籽粒特異表達(dá)的nac轉(zhuǎn)錄因子tanac019-a1和tanac-a18可以同時(shí)參與調(diào)控胚乳淀粉和種子蛋白的積累，助力小麥高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)育種(gao?et?al.,2020；wang?et?al.,2023)。tabhlh95在發(fā)育的籽粒中優(yōu)勢(shì)表達(dá)，通過(guò)正調(diào)控淀粉合成基因agpl1/2和isa1的表達(dá)，促進(jìn)胚乳總淀粉和直鏈淀粉合成，為小麥高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)育種工作提供了新的基因資源(liu?et?al.,2023)。通過(guò)烏拉爾圖小麥克隆的tubzip28能夠促進(jìn)胚乳淀粉合成，而不改變種子蛋白含量，實(shí)現(xiàn)了高產(chǎn)和優(yōu)質(zhì)兼顧的目標(biāo)(song?et?al.,2020)。然而，由于小麥基因組大、淀粉表型鑒定困難等原因，導(dǎo)致控制小麥胚乳淀粉含量的基因克隆和研究不足，可用的分子標(biāo)記較少。因此，開(kāi)發(fā)新的分子標(biāo)記對(duì)于小麥高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)育種具有重要的意義。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本發(fā)明所要解決的技術(shù)問(wèn)題是如何檢測(cè)小麥籽粒淀粉含量。

2、為解決上述技術(shù)問(wèn)題，本發(fā)明首先提供了檢測(cè)小麥淀粉分子標(biāo)記的物質(zhì)在檢測(cè)或輔助檢測(cè)小麥籽粒淀粉含量中的應(yīng)用；

3、所述小麥淀粉分子標(biāo)記為小麥基因組中對(duì)應(yīng)于序列表中seq?id?no.1的第51位的核苷酸，小麥基因組中對(duì)應(yīng)于序列表中seq?id?no.1的第51位的核苷酸為c或t。

4、上述應(yīng)用中，所述檢測(cè)小麥淀粉分子標(biāo)記的物質(zhì)可含有序列表中seq?id?no.2的第22-40位、seq?id?no.3的第22-40位與seq?id?no.4所示的三條單鏈dna組成的引物組。

5、上述應(yīng)用中，所述檢測(cè)小麥淀粉分子標(biāo)記的物質(zhì)可含有序列表中seq?id?no.2、seq?id?no.3與seq?id?no.4所示的三條單鏈dna組成的引物組。

6、所述物質(zhì)還可包括2×kasp?master?mix。所述物質(zhì)可僅為由序列表中seq?idno.2的第1-23位、seq?id?no.3的第1-23位與seq?id?no.4所示的三條單鏈dna組成的引物組，也可僅為由序列表中seq?id?no.2、seq?id?no.3與seq?id?no.4所示的三條單鏈dna組成的引物組，還可由序列表中seq?id?no.2、seq?id?no.3與seq?id?no.4所示的三條單鏈dna組成的引物組與2×kasp?master?mix組成。

7、各引物組中的單鏈dna均可獨(dú)立包裝，各單鏈dna摩爾數(shù)均可相同。

8、上述應(yīng)用中，基因組中對(duì)應(yīng)于序列表中seq?id?no.1的第51位的核苷酸為t的純合型小麥的籽粒淀粉含量高于或候選高于基因組中對(duì)應(yīng)于序列表中seq?id?no.1的第51位的核苷酸為c的純合型小麥。

9、本發(fā)明還提供了檢測(cè)或輔助檢測(cè)小麥籽粒淀粉含量的方法，所述方法包括檢測(cè)所述小麥淀粉分子標(biāo)記，按照如下方法確定小麥籽粒淀粉含量：基因組中對(duì)應(yīng)于序列表中seqid?no.1的第51位的核苷酸為t的純合型小麥的籽粒淀粉含量高于或候選高于基因組中對(duì)應(yīng)于序列表中seq?id?no.1的第51位的核苷酸為c的純合型小麥。

10、上述方法中，檢測(cè)所述小麥淀粉分子標(biāo)記可采用所述檢測(cè)小麥淀粉分子標(biāo)記的物質(zhì)進(jìn)行。

11、所述檢測(cè)小麥淀粉分子標(biāo)記的物質(zhì)，也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。

12、所述小麥淀粉分子標(biāo)記，也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。

13、本發(fā)明還提供了下述任一應(yīng)用：

14、x1)所述小麥淀粉分子標(biāo)記在小麥育種中的應(yīng)用；

15、x2)所述小麥淀粉分子標(biāo)記在檢測(cè)或輔助檢測(cè)小麥籽粒淀粉含量中的應(yīng)用；

16、x3)所述檢測(cè)小麥淀粉分子標(biāo)記的物質(zhì)在小麥育種中的應(yīng)用；

17、x4)所述檢測(cè)小麥淀粉分子標(biāo)記的物質(zhì)在制備小麥育種產(chǎn)品中的應(yīng)用；

18、x5)所述檢測(cè)小麥淀粉分子標(biāo)記的物質(zhì)在制備檢測(cè)或輔助檢測(cè)小麥籽粒淀粉含量產(chǎn)品中的應(yīng)用；

19、x6)所述檢測(cè)或輔助檢測(cè)小麥籽粒淀粉含量的方法在小麥育種中的應(yīng)用；

20、x7)檢測(cè)小麥基因組中對(duì)應(yīng)于序列表中seq?id?no.1的第51位核苷酸的物質(zhì)在選育高籽粒淀粉含量小麥中的應(yīng)用；

21、x8)檢測(cè)小麥基因組中對(duì)應(yīng)于序列表中seq?id?no.1的第51位核苷酸的物質(zhì)在制備選育高籽粒淀粉含量小麥的產(chǎn)品中的應(yīng)用。

22、本發(fā)明還提供了小麥育種方法，所述方法包括：檢測(cè)小麥基因組中對(duì)應(yīng)于序列表中seq?id?no.1的第51位核苷酸，選擇小麥基因組中對(duì)應(yīng)于序列表中seq?id?no.1的第51位核苷酸為t的小麥作為親本進(jìn)行育種。

23、本發(fā)明中，所述籽粒淀粉含量可為籽粒淀粉總含量。

24、實(shí)驗(yàn)證明，本發(fā)明的小麥淀粉分子標(biāo)記與小麥籽粒中的總淀粉含量相關(guān)，基因組中對(duì)應(yīng)于序列表中seq?id?no.1的第51位的核苷酸為t的純合型小麥的籽粒淀粉含量高于基因組中對(duì)應(yīng)于序列表中seq?id?no.1的第51位的核苷酸為c的純合型小麥。本發(fā)明在提高小麥淀粉品質(zhì)的分子標(biāo)記輔助選擇和分子設(shè)計(jì)育種中具有較好的應(yīng)用前景。

25、下面結(jié)合具體實(shí)施方式對(duì)本發(fā)明進(jìn)行進(jìn)一步的詳細(xì)描述，給出的實(shí)施例僅為了闡明本發(fā)明，而不是為了限制本發(fā)明的范圍。以下提供的實(shí)施例可作為本技術(shù)領(lǐng)域普通技術(shù)人員進(jìn)行進(jìn)一步改進(jìn)的指南，并不以任何方式構(gòu)成對(duì)本發(fā)明的限制。